المراجع الاسلامية تذكر ان القرآن جًمع اربع مرات. المرة الاولى كانت ايام النبي حيث كان محفوظا في صدور الصحابة ويسمى بتجميع الصدور. وكانت هناك ايضا اجزاء منه مكتوبة

اول محاولة تجميع للسورفي كتاب واحد كان في عهد ابو بكر, بعد ان مات العديد من الصحابة حفظة القرآن في المعارك والغزوات وخاصة معركة اليمامة. حيث أوكل ابو بكر في عام 11 هـ زيد بن ثابت بهذا العمل فجمع القرآن بحسب القراءات المختلفة, رغم ذلك بقي هناك قرائين اخرى عند الصحابة الذين لم يعترفوا بالقرآن الجديد لاختلافه عما موجود عندهم. حفظت هذه النسخة عند ابو بكر وثم عند عمر بن الخطاب وبعد مقتله تحولت عند حفصة ابنة عمروبعد وفاتها استولى عليه مروان بن الحكم والي المدينة حيث محاالنسخة من الوجود( صحيح البخاري, باب الفتح الحديث رقم 4000 . دلائل النبوة للبيهقي الجزء 3 صفحة 277. الاتقان في علوم القرآن للسيوطي الجزء الاول صفحة 60).
اما التجميع الثاني والمهم تاريخيا هو الذي تم في عهد الخليفةعثمان بن عفان ( وهو أموي النسب). حيث رأى عثمان اقتتال المسلمين حول تفسير القرآن بإختلاف القراءات, فقام وحقنا لدماء المسلمين بإعادة تجميع القرآن سنة 25 هـ. جمع عثمان سبعة قرائين مختلفة( بالرغم من وجود الكثير غيرها). فحرق ستة! وابقى قرآن واحد فقط واجبر الناس على اتباعه!! وارسلت نسخ منه الى مختلف المناطق الاسلامية.علما ان مصحف عثمان يخلوا من التنقيط والتشكيل.
وثم قام الامويون (يبدو ان لهم دورفي كتابة القرآن اكثرمن النبي نفسه ) بإعداد مصحف جديد حسب الرغبة مضبوط بالشكل والتنقيط.
يقول السيوطي في كتابه الاتقان في علم القرآن صفحة351: لما كثر الخطأ في قراءة القرآن بسبب عدم احتوائه على التشكيل والتنقيط عهد الحجاج بن يوسف الثقفي( المعروف ببطشه واعتداده وفخره بنفسه حيث أراد ان يضع لنفسه بصمات واثار على القرآن) الى نصر بن عاصم بضبط القرآن وكان نصر فصيحا بليغا معروفا بإعتماد الالفاظ الجزلة الضخمة غير المألوفة والاستشهاد بما يماثلها من أشعار (وهو سبب ظهور القرآن بهذه الفصاحة والذي لم يتحرأ بالاتيان بمثله الا طه حسين في كتابه الشعر الجاهلي).ويعتبر مصحف الحجاج اساس القرآن المتداول حاليا.

والسؤال الان اليس القرأن كتابا في لوح محفوظ ثابت لايتغير. فكيف اًمكن تدميره وحرقه وتغييره!
يذكر السجستاني المتوفي سنة 613 هـ في كتابه "المصاحف" بوجود العديد من المصاحف المختلفة بلغت اكثر من عشرين قرآنا, وكتب نبذة عن كل مصحف منها. من هذه المصاحف مصحف عمر بن الخطاب وعلي بن ابي طالب وابي ابن كعب وسالم مولى حذيفة وعبدالله بن مسعود وابو موسى الاشعري وعبدالله بن عمر ومعاذ بن جبل وعبدالله بن عباس وعبدالله بن الزبير وعائشة وام سلمى وعبيد بن عمير الليثي وسعيد بن جبير والاسود ابن زيد ومحمد بن ابي موسى وطلحة بن مصرف وعطاء ابن أبي رباح وغيرهم. ولم تكن نسخ لمصحف واحد بل عدة مصاحف. يذكر السجستاني ايضا في كتابه في صفحة 5 نقلا عن عبدالله ابن مسعود الذي حفظ عن النبي اكثر من
70 سورة عن وجود اكثر من 1700 إختلاف بين هذه المصاحف ويشرح في الكتاب نماذج متعددة من هذه الاختلافات.
يؤكد كتاب آخر هو"معجم القراءات القرآنية" (والمؤلف من قبل الدكتور عبد العال سالم مكرم والدكتور احمد مختار عمر الذي نشرته دارالسلاسل في الكويت عام 1982 بدعم من جامعة الكويت) بوجود عدد كبير من القرائين في عهد عثمان الذي امر بإحراق المصاحف التي وصلت اليه وابقى واحدا فقط. يذكرالكتاب منها مصحف علي بن ابي طالب وابن مسعود وابي ابن كعب وغيرهم من المذكورين اعلاه. ويذكر الكتاب ايضا اختلافات في طرق القراءات ويحدد تلك الاختلافات بما يلي:
- اختلاف في الاملاء.
- اختلاف في الحركات.
- اختلاف في الاعراب.
- الاستبدال بكلمات مشابهة.
- تغيير في مواضع الكلمات.
- إضافة أو حذف كلمات.
من خلال ذلك كله يتبين ان الاختلاف الموجود حاليا بين ايات وسور القرآن ليس بسبب ما يسمى الناسخ والمنسوخ أو ان الله كان له بها حكمة, وانما السبب ان قرآن عثمان ومن ثم قرآن الحجاج بن يوسف الثقفي جًمع من مصاحف مختلفة وأًدخلت آيات جديدة تفيد المرحلة لتنفيذ مآرب وغايات الحكام الامويين دون النظر الى الاختلافات الموجودة والتي اظهرت التناقض في الآيات. علما ان الاحاديث النبوية جمعت بنفس الاسلوب ايضا لتنفيذ مصلحة وغاية الحكام الامويين.